Baltijos jūra yra viena iš labiausiai eutrofikacijos paveiktų jūrų pasaulyje. Perteklinio maistinių medžiagų kiekio sukelta eutrofikacija lemia dumblių žydėjimą, deguonies stygių, vandens floros ir faunos nykimą, ekosisteminių jūros teikiamų paslaugų mažėjimą.